Araştırma: Özel Tasarım "Düzensiz Proteinler" Burada

Son yıllarda belirli işlevlere sahip özel proteinlerin tasarımında kaydedilen önemli ilerlemelerin ardından, artık sabit bir şekle sahip olmayan, sürekli değişen düzensiz moleküller oluşturmak mümkün. Bu önemli başarı , Harvard ve Amerika Birleşik Devletleri'ndeki Northwestern Üniversitesi araştırmacıları tarafından geliştirilen yeni bir yapay zeka tabanlı yöntem sayesinde elde edildi. Bu yöntem, 2024 Nobel Kimya Ödülü sahibi İngiliz Google DeepMind şirketinin AlphaFold adlı sisteminde de mevcut olan bir boşluğu dolduruyor.

Nature Computational Science dergisinde yayınlanan çalışma, Parkinson gibi düzensiz proteinleri içeren çeşitli hastalıkların kökenleri ve potansiyel tedavileri konusunda ışık tutacak. Çok sayıda işlevde kilit rol oynayan insan DNA'sında ifade edilen proteinlerin yüzde 30'u düzensiz bir yapıya sahip ve bu nedenle en güçlü yapay zeka araçları için bile tahmin edilmesi çok zor. Bu sorunu çözmek için Harvard'dan Ryan Krueger ve Northwestern'den Krishna Shrinivas liderliğindeki araştırmacılar , diğer alanlarda zaten kullanılan algoritmalardan yararlandı . Bu algoritmalar, bir bilgisayarı, bir proteini oluşturan amino asit dizilerindeki çok küçük değişikliklerin bile molekülün nihai özelliklerini nasıl etkilediğini tanıyacak şekilde eğitmelerine olanak tanıdı. Daha sonra, belirli bir işlevi yerine getirmek için en uygun amino asitleri seçebilen bir arama motoruna bağlandılar ve böylece istenen özelliklere sahip proteinler tasarladılar. Sonuç olarak, ortaya çıkan moleküller yapay zeka hipotezleri değil, proteinlerin doğada nasıl davrandığına dayanıyor.